Gia nhập Tổ chức thương mại thế giới (WTO), hội nhập kinh tế quốc tế vừa có cơ hội lớn, vừa phải đối đầu với thách thức không nhỏ. Thương mại sinh thái cũng nằm trong bối cảnh đó, tuy nhiên khi mà các sản phẩm công nghiệp ngày càng khó cạnh tranh, yêu cầu về chất lượng của hàng hóa nông sản ngày càng khắt khe thì sản phẩm nông sản sinh thái đang thể hiện được những ưu thế và lợi ích của mình. Chính vì vậy, thúc đẩy thương mại sinh thái trong bối cảnh gia nhập WTO là rất cần thiết để phát triển Nông nghiệp sinh thái.